Gaussian入門（三）—模型建立（高斯建模）
- 有單晶結(jié)構(gòu)：從cif文件建立
- 無(wú)單晶結(jié)構(gòu)：GaussView建模
- ChemOffice建模
一、GaussView簡(jiǎn)介
1、GaussView的功能
- Gaussian的配套可視化工具
- 計(jì)算模型的建立
- 輸入文件的建立
- 結(jié)果的可視化
- 軌道圖形的查看
- 振動(dòng)模式的歸屬
- 光譜結(jié)果的查看
2、GaussView注意事項(xiàng)
不建議用Calculate向Gaussian提交計(jì)算任務(wù)
- 有冗余坐標(biāo)
- 有些非必須關(guān)鍵詞
- 輸出信息并未指定
二、從cif文件建立模型
1、單晶數(shù)據(jù)來(lái)源
- CCDC官網(wǎng)查詢已有的單晶結(jié)構(gòu)下載 https://www.ccdc.cam.ac.uk/
- 離線軟件CSD下載
- 最新的文獻(xiàn)報(bào)道的單晶
- X-射線單晶衍射
2、步驟
- 用diamond等打開(kāi)cif文件，取出結(jié)構(gòu)單元
- 保存為.mol，.mol2文件格式
- 用GaussView打開(kāi)再保存為.gif文件
3、從ChemOffice建模
- 使用ChemDraw建立平面結(jié)構(gòu)
- 導(dǎo)入Chem3D顯示3D結(jié)構(gòu)
- 保存為.mol2格式
- 使用GaussView打開(kāi)，保存為.gif格式
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